Првобитно населено пред 7.200 години, Преспанското Езеро содржи бројни археолошки наоѓалишта
Најдобро зачувани се оние на островите Голем Град во неговиот македонски дел и Мали Град (во албанскиот дел), каде се наоѓа и црквата Св. Марија (на сликата). На овие локации откриени се артефакти од речиси 4 милениуми човекова активност — од околу 2200 г. п.н.е. до османлиското освојување кон крајот на XIV век н.е..